1、生物类型不同:细菌没有核膜包围形成的细胞核,属于原核生物。真菌有核膜包围形成的细胞核,属于真核生物。
2、细胞结构不同:一是细胞壁的成分不同,细菌细胞壁的主要成分是肽聚糖,而真菌细胞壁的主要成分是几丁质。二是细胞质中的细胞器组成不同,细菌只有核糖体一种细胞器。而真菌除具有核糖体外,还有内质网、高尔基体、线粒体、中心体等多种细胞器
3、细胞大小不同:原核细胞一般较小,直径一般为1μm~10μm。真核细胞较大,直径一般为10μm~100μm。
4、增殖方式不同:细菌是原核生物,为单细胞型生物,通过细胞分裂而增殖,具有原核生物增殖的特有方式,为二分裂。真菌为真核生物,细胞的增殖主要通过有丝分裂进行。
5、名称组成不同:尽管在细菌和真菌的名称中都有一个菌字,但细菌的名称中一般含有球、杆、弧、螺旋等描述细菌形态的名称,而真菌名称中则不含有。